在讲清这一点的同时，大本营还授权方面军司令员“在战役中根据情况改变本方面军备案团军之间的分界线，改变个别集团军的突击方向，事后再报告大本营。”各方面军司令员应立即将这些指示向集团军司令员们交待清楚。
随后，大本营于1942年6月4日向各方面军和集团军的军事委员会下达指令，分析了克里木方面军在5月8日到20日的战斗中失利的原因，指出在刻赤战役中方面军首长、大本营代表以及某些集团军司令员对部队指挥不力，这一情况说明他们不懂得“现代战争的性质。”指出克里木方面军没有在防御纵深各地区展开强大的第二和第三梯队。“克里木方面军首长把各师展开在—条线上，而没有考虑到开阔平原的地形特点……当敌人突破战线后，方面军首长无法调集足够的兵力来阻档进攻的敌军。”指令还指出，因方面军司令部的疏忽而延误了组织反突击。当敌人的航空兵炸毁了方面军和集团军的的指挥所，破坏了方面军和集团军司令部指挥的方线通信，摧毁了通信枢组部的时候，无线电通信却由于方面军司令部的疏忽而被“搁置”了。指令中批评方面军首长没有组织各集团军之间的协同动作，完全没有保障方面军地面部队和航空兵之间的协同动作。在必须把方面军的各集团军有次序的撤到“土尔其堡垒”阵地的形势已经明朗的情况下，方面军首长又没有执行大本营撤退部队的命令。“撤退部队延误两天对整个战役的结局来说是极其有害的。”方面军首长下达命令时，没有考虑前线的情况，也不了解军队的实际位置。
关于哈尔科夫战役及其结局对苏德战场尔后事态的发展的影响，国外历史书籍中有不少的记述。前希待勒的将军库尔特·蒂佩尔斯希就这个问题这样写道：“对于德国已计划好了的进攻来说，俄国人只是企图袭扰一下，这正是所期望的一个开端。俄国人防御实力受到削弱，将会使最初的战役更容易达到目的，但要做到这一点，也并不那么容易。在开始进攻之前，还需要进行补充准备，德国各集团军首先要进行重新部署，要补足全部必须品，这一准备用去了将近整整一个月的时间。”
英国军事历史学家Д·Ж·富列尔对这一事件却有不同的看法。他写道：“6月1日德国宣布大获全胜，但是对他们来说，这次进攻并不是一件愉快的事情。”我们且不谈这些见解的主观方面(这次进攻是敌人所期望的呢，还是令人不愉快的?)，只是想指出苏军在哈尔科夫和刻赤半岛的失利及其塞瓦斯托波尔的撤退，急剧改变了苏德战场南翼的局势，帮助了敌人重新夺得战略主动权。在战场的这一地段上的力量对比发生了有利于敌人的变化。此外，敌人肃清巴尔温科沃突出部的苏军之后，为继续展开进攻，占据了有利的出发阵地。
因此，1942年5、6月前线的局势虽然不是完全按照德国最高统帅部的总意图发展的，但至少在总的方面是不利于苏军的。敌人分阶段地实施预定的战役，逐走接近了苏德战场的南翼实施一次决定性进攻的目的。第41号指令把“击溃和消灭沃罗涅日地区，它的南面，以及顿河西面和北面的俄国军队”看作是希特勒军队的主要目标之一。6月初，为了贯彻上述指令，法西斯德国统帅部拟定了在沃罗涅日和坎捷米罗夫卡方向实施进攻战役的计划。这些战役的实施，应该是敌人所计划的1942年夏季攻势的人规模进攻的开始。
敌军沿向心方向(从库尔斯克东北地区向沃罗涅日和从沃尔昌斯克地区向奥斯特罗戈日斯克)实施两个突击来完成对沃罗涅日的突破。在这次进攻战役过程中，敌人企图消灭沃罗涅日方向上的苏联防御军队，前出到沃罗涅日到新卡利特瓦这一段的顿河，井在顿河左岸夺取登陆场。前出到沃罗涅日后，敌人的快速兵团应沿顿河转向南，向西南方面军的后方——坎捷米罗夫卡方向实施突击。同时，在斯拉维扬斯克、阿尔莫夫斯克、克拉马托尔斯克地区集结的敌军集团，应在西南方面军和南方面军的接合部实施突破，并向坎捷米罗夫卡发展突击，完成对西南方面军主要兵力的合围，在斯大林格勒和北高加索两个方向上发展胜利。
在西南方向上准备进攻时，德国最高统帅部决定把“南方”集团军群划编为由利斯特元帅指挥的“A”集团军群(其编成内有德国坦克第1集团军，野战第17和11集团军以及意大利第8集团军，向高加索方向实施突击)和由冯·博克元帅指挥的“Б”集团军群(其编成内有德国坦克第二集团军、野战第2和6集团军以及匈牙利第2集团军，向斯大林格勒实施突击)。
夏季一开始，苏联最高统帅部大本营愈来愈注意观察西南方向上正在形成的局势。斯大林和华西列夫斯基与西南方面军军事委员会6月20日的通话记录可以证实这一点。
华西列夫斯基说：“斯大林同志马上要讲话。大本营要求你们简要地报告一下情况。你们对截获的德国文件有什么看法，以及你们认为当前所必须采取的措施是什么。”
铁木辛哥报告说，截获的敌人文件是无可怀疑的。文件是由几名军官乘战斗机护送的。飞机是由于天气不好，迷失了方向，飞入军队高射炮兵的火力因而被击落的。有两名军官；一名是飞行员，在飞机坠毁时被烧死，另一名活着的少校军官企图销毁文件并躲藏起来，在对射时被击毙。他接着说道：“据我们估计，敌人的企图可归结如下：敌人企图打败我们翼侧的各集团军，而后从瓦卢伊基——库皮杨斯克一线威胁我方部队。”
斯大林走到电话机旁，说：“首先，尽力保守我们截获了这一命令的秘密。第二，所截获的命令可能只暴露了敌人作战计划的一部分。可以认为，其他战线也会有类似的计划。我们认为，德国力图在战争一周年的时候搞出点什么名堂，并把他们的战役安排在这一天实施。”
这里提到的敌人进攻的时间整整相差6天，但苏联统帅部始终未能获悉希特勒匪徒的主要意图。
1942年６月底，敌人在库尔斯克至塔甘罗格地带集结了9万名官兵，1260辆坦克、1万7千多门火炮和迫击炮，1640架作战飞机。这个集团的编成内拥有的步兵和骑兵占当时敌人集中在苏德战场上的约百分之三十七，坦克和摩托化兵团占百分之五十多。在库尔斯克以东、哈尔科夫东北和顿巴斯，集结了敌人几个强大的突击集团。在这些集团正面占领防御阵地的是苏联的布良斯克、西南和南方三个方面军(方面军司令员分别是Ф·П戈利科夫中将、苏联元帅铁木辛哥和Ｐ·Я·马利诺夫斯基中将)，它们拥有的人数和坦克大约与敌人相同，但是飞机和火炮大大少于敌军。
苏德战场南段总的力量对比有利于敌人。苏联军队在克里木和哈尔科夫地区遭受了很大伤亡之后，还没来得及得到补充和休整，还未能巩固新的防御地区。西南方向上的预备队在艰苦的5月和6月战斗中基本上消耗殆尽。1942年6月底西南方向上的苏联军队的力量是薄弱的。在主要突击方向上，敌人比苏联军队占有极大的数量优势。希特勒大本营从东晋鲁士迁到乌克兰的文尼察地区。
敌人未能按照预定期限准时地完成突击集团兵力的集结。原定于6月１５日在沃罗涅日方向实施的进攻推迟到18日，接着又改在6月27日，后来又推迟了一天。战役开始日期一再推迟是塞瓦斯托波尔战斗行动拖得太长的结果，当时第4航空队相当大的一部分飞机都在那里作战。
6月28日清晨，组成“魏克斯”集团军群的敌3个集团军(德国野战第2集团军和坦克第4集团军及匈牙利第2集团军)，在炮火和航空兵火力准备之后，对布良斯克方面军左翼部队展开了进攻。敌军集团的主要兵力，其中包括坦克第4集团军，在库尔斯克—沃罗涅日铁路线以北实施突击。在第一梯队实施进攻的有7个步兵师、3个坦克师和3个摩托化师。支援地面部队的是第4航空队。
在敌主要突击方向上进行防御的第一梯队是第13集团军(司令员Ｈ·П·普霍夫少将)的两个步兵师和第40集团军(司令员Ｍ·Ａ·帕尔谢戈夫炮兵中将)的一个师。在敌人优势兵力的猛攻下，苏联军队的防御被突破，7月2日日终前，敌人的快速兵团前出到了卡斯托尔诺耶——旧奥斯科尔铁路一线。最高统帅部大本营和布良斯克方面军首长为加强防彻虽然采取了措施，但是未能改变总的情况和阻止敌军的推进。这时，敌人在南面已取得了初步的胜利。
6月30日，德国第6集团军的突击集团从沃尔昌斯克地区转入向奥斯特罗戈日斯克进攻，突破了西南方面军右翼的第2l集团军(司令员B·H·戈尔多夫少将)和第28集团军(司令员Д·Ｎ·里亚贝舍夫中将)的防御。这样一来，敌人凭借优势兵力，特别是坦克、炮兵和飞机方面的优势，在布良斯克方面军左翼和西南方面军右翼突破了防御。敌军的总的推进方向是指向沃罗涅日和旧奥斯科尔。
副总参谋长Ｈ·Ф·瓦图京中将于7月2日16时5分向西南方面军司令员、苏联元帅铁木辛哥转达了最高统帅斯大林的命令：
“敌人在你方正面突过了奥斯科尔河，并正在河东岸西南方面军的后方集结兵力。