方云决定定都北京，是符合大汉民族的历史习惯的，南面有了桐梓，北面也要有第二个“桐梓”，而位于华北要冲重镇的北京，就成为首选，况且，北京拥有人口一百多万，比较适合发展。
被称为大汉帝国六星的直辖市中，彼此之间有铁路联系的，只有桐梓、上海、天津和北京，拉萨、库伦没有铁路线相通，修建北京到库伦的铁路线都还不是大问题，但是要修建到拉萨的铁路，就是困难重重了。但是，为了大汉帝国国防军事工程的完整化，帝国政府还是同意修建西部铁路网，这些铁路包括兰州――武威――玉门――乌鲁木齐（迪化）；兰州――西宁――格尔木；格尔木――温泉――那曲――拉萨，政府总共投资一百亿，全部工程计划在五年内完成。在这些计划的实施中，帝国集中营里面的大批战俘、罪犯人员被充分利用起来，他们将承担最艰苦最危险的工作。
由方云亲自建立起来的秘密基地龙隐，已经开始源源不断地为帝国政府提供各式各样的专业人才，这些人忠诚、专业，很快就在各个基层部门站稳了脚跟，成为了方云政权的重要基层力量，也让历代头痛的吏治问题得到了一定程度上的改善。
但是，并不都是所有的事情都是和谐的。比如，在政府经济部任职的龙图先生，就在昆明召开的国家经济发展研讨会上，龙图先生就抛出他的高论：“大汉帝国不必有自己的汽车自主品牌”“大汉帝国汽车做世界的车间才好呢！”，“今后在大汉帝国本土生产的汽车，叫什么名字已经不重要了”，蛊惑人心，典型的卖国汉奸言论，见诸报端后引起舆论的强烈反响。作为大汉帝国蓝岭汽车股份有限公司的董事长林光远驳斥了他的言论，说明他是犯了原则上的错误，难道世界上真的有免费的午餐？这些言论也只是符合了外资企业的胃口。
当前，外资汽车企业和大汉帝国汽车企业在国内竞争得非常厉害。但是，大汉政府明令政府用车一律采购国内企业生产的汽车，并号召广大人民支持国有品牌。所以，龙图的言论和政府的政策方向是背道而驰的。
就在龙图的言论发表后的第二天，帝国经济部就发表声明，说龙图先生的言论只是代表他个人而已，不代表帝国经济部。但是，鉴于龙图先生的言论已经严重影响了帝国经济部的形象，已经不再适合在经济部任职。
这份声明非常明确地表明了大汉政府对待本土企业的态度。
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对于台湾省的重要性，大汉帝国每一个将军都清楚。在经过国防部参谋总部的讨论研究后，决定由南方军区总司令张连武将军担任解放台湾战役的总司令，南方军区副总司令江涛将军任前指总司令，张绍甫将军任前指总政治委员，薛毅将军任前指参谋总长。这样，昔日的老对手成了一同作战的亲密战友，也从一个侧面反映了大汉帝国对军队改造的成功。
参战的部队有国防军的第七军，海军的第一、第二海军陆战师，海军的第一舰队、潜水舰队的南海舰队，空军的第一、第二、第四航空联队和海军航空兵第一联队，总兵力18万，称为D集团军。
西元1938年3月2日凌晨，庞大的登陆舰队从厦门港起航，直扑台湾的门户澎湖。上午9点，近300架战斗机和轰炸机对澎湖列岛实施了大规模的轰炸，重点打击了澎湖的机场、港口和交通枢纽。
上午11点，在经过300多架战机近两小时的狂轰烂炸后，D集团军的先头登陆部队第一海军陆战师白沙登陆，几乎没有遇到什么像样的抵抗。下午3点，第一海军陆战师在白沙建立起了坚固的桥头堡，后续部队和装备源源不断地运了上来。
3日清晨，在得到豹式坦克和155MM重炮等重型装备加强后，第一海军陆战师开始向湖西机场进攻。守备澎湖的师日驻台湾的一个守备旅团和一个预备役联队，根本就不是装备和训练精良的海军陆战师的对手，而且部队当中大多数都是台湾本地人，当听到是自己祖国的部队打过来的时候，不少官兵都举行了战场起义，杀死鬼子汉奸军官，欢迎自己祖国的部队。所战斗很顺利，下午5点，澎湖岛的重要港口澎湖也落入了大汉帝国手中，澎湖列岛顺利解放。
4日，澎湖列岛解放的消息传到了台湾，令广大的爱国民众欢心鼓舞，纷纷做好了迎接部队进城的准备。
5日，第一舰队护送着登陆舰队进入澎湖水道，在台南一带沿海登陆成功，并建立了登陆场。到5日傍晚，已经有两个整编师的人员和装备被运到了登陆场。第七军的56师连夜对台南县发起了攻击，他们一路推进，并没有遭受到什么像样的拦截，只是在经过台南县的时候，遇上了一点麻烦：这里有日本人的一个步兵加强联队和一个重山炮联队，人数约有6000人，是日军驻台湾第8师团的主力部队。
战斗很快就打响了。56师先是派出小股部队实施火力侦察，搞清楚日军的防御火力点，随后在炮火的掩护下，56师对日军发起了进攻。台南日军阵地硝烟弥漫，爆炸声不绝，泥土、砖石横飞。在黑夜中，豹式坦克庞大的身躯碾过铁丝网、鹿砦，为后面的步兵开辟通道，而喷火坦克则是对一个个漏网的日军残余火力点进行点杀，火焰漫天。鬼子无论从装备还是士气上，都不是大汉军队的对手，所以根本抵挡不住对手的进攻，节节败退。到第二天天亮，台南县被胜利解放。有了台南地区作为依托后，D集团军的攻势就更加凌厉了。
长时间的潜艇封锁，使得台湾省的经济、民生极度恶化。为了抢夺必要的物资、粮食，鬼子和台湾老百姓之间的冲突不断，甚至和一些台湾原住民的部队冲突也不断，彼此间的仇恨很深。所以，当知道祖国的部队在台南县登陆成功的消息后，不少地方都爆发了起义，当地的老百姓积极地给部队做向导，这些都让江涛的D集团军进展顺利。
3月7日清晨，第一舰队出现在台湾省北部的基隆港外面，对港口驻军进行炮击。基隆港这几年来，一直是日联合舰队的锚地，设施还是完善的，有5000人的鬼子驻军。港口内还有一些小型炮艇和原联合舰队的补给船只。在舰炮的掩护下，第二海军陆战师在离基隆港约有10公里远的金山村登陆成功，随即南下包围了基隆港，把鬼子的部队赶出了港口。
3月7日中午，一个令人震惊的消息传到了D集团军司令部：溃逃的日第8师团的残部，在沙鹿村制造了惊天血案，屠杀了300多名村民！这让张绍甫和薛毅两位将军非常愤怒，张绍甫将军当即下了命令，不接受任何一个第8师团的鬼子的投降！凡是第8师团的鬼子官兵，一律格杀勿论！
3月9日，大汉帝国军队占领了台北，宣布台湾省解放。整个战役历时8天。薛毅将军在鬼子俘虏中，又找出了1000多名第8师团的俘虏和伤兵。他把这些凶手全部拉到郊区刑场给枪毙了。薛毅将军也因此获得了一个杀人将军的外号。
随着台湾省被攻占，大汉帝国的领土已经是恢复完整，这是一件举国振奋的事情。同时，对日本本岛的攻势也被提了出来。要进攻日本，必须要有强大的海军舰队。日海军虽然主力舰队在钓鱼岛海战中已经被消灭，但是背水一战的潜力还是有的。要真正意义上攻击日本本土，就首先要日本本岛的九州岛，以获取进攻的跳板。
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在风景秀丽的罗布泊，鼎立着一个大型的军事工业区，这就是大汉帝国著名的第19区（龙腾基地）。在基地的研究中心实验室中，著名的犹太科学家爱因斯坦正在给大汉帝国总统方云详细第解释核裂变原理。
进入西元20世纪后，科学家爱因斯坦提出了质量能量公式，揭示出人类可以将物质的部分质量直接转换为巨大的、并能被人类直接利用的能量。接着，丹麦的波尔、意大利的费米和德国的哈恩等人又进一步论证出核能可以释放出的惊人力量。这些科学家到达大汉帝国之后，得到了方云的热情支持和接待，而且大汉政府投入了大量的资金和人力，建立了巨大的重水车间。就此，大汉帝国制造原子弹具备了最优越的人力物力资源。
西元1938年夏，由于希特勒的野心和扩张，欧洲战争爆发在即，爱因斯坦担心德国造出核武器，便向大汉帝国政府提出应抢先研制。几乎没有这类知识的官员没有将此建议视为天方夜谭，而是秘密向国安局的杜英豪做了汇报，很快，这份秘密报告就递交到了方云的手里。于是，对此事极其重视的方云决定亲自到19区考察，并亲自聆听爱因斯坦对这个计划的说明。
对于方云理解和接收新知识的速度，爱因斯坦非常惊异。在听了爱因斯坦说明核裂变可制造出威力巨大的新型炸弹后，方云忍不住问道：“如果要炸掉一个像南京那么大的城市，原子弹需要多大？”
“只需要这么大的一块浓缩铀。”爱因斯坦指着一个口径是20CM容器说道。一向敬重爱因斯坦的方云听后，非常吃惊。这也让他了解到制造原子弹的可行性。通过这次有历史意义的交谈，方云做出了一个重大的决策：要赶在德国人之前造出原子弹。
研制原子弹是一项绝密项目，方云决定不能让任何一个国家和政府知道，包括暂时的盟友美国和德国。政府内只有总统方云、国安局局长杜英豪和国防军总司令孙仲伦元帅等几人了解此事。