分类，是思维导图概念中最重要的基础能力，唯有具备清晰的分类概念，才能绘制出合乎逻辑、层次分明的思维导图。
分类有四个重点，第一个重点是最理想的类别数量是四到六组，最多不超过九组；另外两个重点则是两个八字要诀：一是“彼此互斥，绝不遗漏”，二是“同一位阶，同一逻辑”；最后一个重点是“高频优选”。
（1）理想分类数：四到六组之间
为什么分类时分成四到六组最理想？根据研究，人的短期记忆一次只能容纳七加减二组的概念，意即在短期记忆的运作中，普通人一次只能记住五到九个物品、概念、数字等，而令人遗憾的是，我们的短期记忆容量常常不是趋近九，而是趋近五。
因为这样的原因，所以如果只有四到六类，记忆起来会比较轻松，大脑也比较容易接受。也许有人会问：“那分成两类不就最轻松好记吗？”这可就不一定了。如果东西很多，而我们只把它们分成两类，就意味着每一个类别之下都包含很多的东西，那会导致虽然记住类别名称，但每个类别之下有哪些东西却记不住的结果。如果这一大堆东西确实是先分成两大类较恰当，那么在每一大类之下，就得再分成几个中类，甚至中类之下再分成几小类。
当然，如果物品量很少，就不用这么大费周折了，分类是在信息庞杂需要整理的情况下才有必要。
（2）彼此互斥，绝不遗漏
所谓的“彼此互斥”，是指当你将几项物品归纳在某一类，并为此类别命名后，归在其他类别的物品就不适合出现在这一类。例如，人、猫、狗、鸡、虾、鱼，有些人可能会分成“人类”和“动物类”，但人也是动物，所以这个分类显然有问题；如果分成“可食”和“不可食”，那也会有很大问题，因为有些人认为人、猫、狗是不可食的，但不可否认的，还是有所谓的食人族、吃猫吃狗的人存在；如果分成“水中生物”和“陆上生物”，可能就会好一些，毕竟在一般人认知中，虾和鱼生长在水中，而人、猫、狗、鸡主要活动范围则是在陆地上，所以，分类除了要符合目的性之外，要尽量以争议性最少的方式为主。
至于“绝不遗漏”的概念则简单多了，就是列出的类别必须要能包含所有的物品，注意在分类上不要使用“其他类”，因为“其他类”就等同于“没分类”，在思维导图的分类概念上这是要尽量避免的。
因此，“彼此互斥，绝不遗漏”的概念，就是类与类之间，不能有重叠的概念，而且列出的类别必须要能包含所有的项目。
（3）同一位阶，同一逻辑
所谓的“同一位阶，同一逻辑”，就是在同一阶层的类别，必须具有相同的逻辑属性。例如，蔬果类和动物类的“地位”相近，可以摆在同一阶层上，“西瓜”和“动物类”的阶层就不同，在分类时不能摆在同一阶层上。如下方图示。
从这张图中可以看出，蔬果类和动物类属于同一位阶的大类；鸟类、爬虫类、哺乳类同属于动物类之下的小类；叶菜类、根茎类、瓜果类同属于蔬果类之下的小类；麻雀、绿绣眼同属于鸟类之下的项目；小白菜、空心菜同属于叶菜类之下的项目。处在同一位阶的概念范畴，大抵上是差不多的，这就是所谓的“同一位阶，同一逻辑”的概念。但有时我们在制作思维导图时，会发现无法完全呼应这个要求，因为有些叙述方式本身就没有按照位阶、逻辑的概念去叙述，这时，只要让各主干之间及各主干之下的支干，在可能的范围内“同一逻辑”即可。
（4）高频优选
分类的方式没有标准答案，除了符合上述三个原则之外，就是比较“高频”率出现的分类方式，“优”先“选”择。
例如，自我介绍常见的分类方式是“教育背景”“兴趣爱好”“家庭状况”“工作经验”“自我期许”等，活动计划则是常以5W2H来分类构思各个事项。